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Wetern Blot蛋白印跡實(shí)驗(yàn)方法及步驟

 更新時(shí)間:2022-11-10 點(diǎn)擊量:1263
Wetern Blot蛋白印跡實(shí)驗(yàn)方法及步驟
蛋白免疫印跡法是蛋白質(zhì)學(xué)中常用的檢測(cè)方法,Wetern Blot-蛋白印跡實(shí)驗(yàn)步驟

主要是通過(guò)SDS凝膠分離、轉(zhuǎn)印到膜上并進(jìn)行信號(hào)檢測(cè)的方法。具體實(shí)驗(yàn)方法如下:
一、試劑和緩沖液
  • l 1x RIPA 緩沖液:50 mM Tris、 150 mM NaCl 、0.1% SDS、0.5% 脫氧膽酸鈉、 1% Triton X-100 或 NP40。

  • l 1x PBS 緩沖液:137 mM NaCl、2.7 mM KCl 、2.7 mM Na 2 HPO 4、2.7 mM KH 2 PO 4、 pH 7.4

  • l BCA 蛋白檢測(cè)試劑盒或 Bradford 蛋白檢測(cè)試劑盒

  • l 1.5 M Tris 緩沖液 (pH 8.8): 90.68 g Tris-HCl 至 ddH 2 O,使用 HCl 將 pH 調(diào)節(jié)至 8.8,最后 500 ml

  • l 1.0 M Tris 緩沖液 (pH 6.8):60.58 g Tris-HCl 至 ddH 2 O,使用 HCl 將 pH 調(diào)節(jié)至 6.8,最后 500 ml

  • l 10% APS:使用前制備的 1 ml ddH 2 O中的 100 mg AP 。

  • l 10% SDS:10 g SDS 在 100 ml ddH 2 O 中。

  • l 1x Tris-甘氨酸緩沖液:Tris配比25 mM;  PH=8.3 的甘氨酸配比230 mM、 SDS配比0.1% 。

  • l 3x SDS 蛋白上樣緩沖液配制:使用PH=6.8 的 Tris 150 mM 、SDS添加6% 、甘油 添加30% 、 EDTA濃度30 mM 和 溴酚藍(lán) 配比0.2% 。緩沖液應(yīng)隨用隨配、分裝冷凍備用。1x TTBS : 25 mM Tris(pH 7.5):0.15 M NaCl 、 0.05% Tween-20、0.001% 硫柳汞

  • l 1x 轉(zhuǎn)移緩沖液:3 g Tris、14.4 g 甘氨酸和 200 ml 甲醇,添加 ddH 2 O 至 1L


二、樣品制備
樣品也可以在一些商業(yè)裂解緩沖液中裂解,例如Thermo Fisher的 Pierce IP 裂解緩沖液 ,而不是 RIPA 緩沖液。

三、細(xì)胞培養(yǎng)樣品制備
1. 貼壁細(xì)胞
  • l 去除上清液并用 1X PBS 洗滌以去除殘留培養(yǎng)基。

  • l 添加預(yù)冷的 400 ul-1 ml 1X RIPA 緩沖液/100 mm 培養(yǎng)皿。在冰上孵育 5-10 分鐘。

  • l 刮去細(xì)胞并轉(zhuǎn)移到冰上預(yù)冷的 1.5 ml 微管中。

  • l (可選)均質(zhì)化或超聲處理。

  • l 4°C 12,000 rpm 離心 10-15 分鐘,收集上清液備用。

  • l 總蛋白應(yīng)儲(chǔ)存在 -20°C 直至需要。 

2. 上清細(xì)胞
  • l (可選)取出 100 ul 等分試樣進(jìn)行細(xì)胞計(jì)數(shù)。

  • l 將細(xì)胞轉(zhuǎn)移到預(yù)冷的 1.5 ml 微管或 15 ml 試管中,并在 4°C 下以 2000 rpm 的速度離心 5 分鐘。

  • l 取出培養(yǎng)基,用 1 ml 預(yù)冷的 1x PBS 重懸沉淀,然后轉(zhuǎn)移到 1.5 ml 微管中。

  • l 在 4°C 下以 2000 rpm 離心 5 分鐘。

  • l 用 1 ml 預(yù)冷 RIPA 緩沖液/10 7 個(gè)細(xì)胞重懸細(xì)胞沉淀

  • l 將細(xì)胞懸液在冰上搖晃 30 分鐘。或均質(zhì)化/超聲處理。

  • l 4°C 12000 rpm 離心 10-15 分鐘,收集上清液備用。

  • l 總蛋白應(yīng)儲(chǔ)存在 -20°C 直至需要。

3.組織制備
  • l 組織制備和定量。把它們切成小塊。

  • l 添加約 500-600 ul 預(yù)冷的 1x RIPA 緩沖液/100 mg 組織。

  • l 均勻組織。

  • l 在 4°C 下以 12000 rpm 離心 15-20 分鐘。

  • l 收集上清液備用。

  • l 總蛋白應(yīng)儲(chǔ)存在 -20°C 直至需要。



 
分離凝膠濃度(%)蛋白質(zhì)大小范圍 (kDa)
825-200
1015-100
12.510-70
1512-45
204-40
 上圖中:蛋白質(zhì)分離范圍由分辨凝膠濃度決定。Tricine-SDS-PAGE 可用于分離小于 30 kDa 的蛋白質(zhì)的電泳系統(tǒng) 。

四、蛋白質(zhì)定量
蛋白印跡實(shí)驗(yàn)步驟中的蛋白定量主要采用Bradford 法和 BCA 法。
1. SDS-PAGE聚丙烯酰胺凝膠制備:6%-15% 分離凝膠由頂部的濃縮凝膠 (5%) 和凝膠梳(10 或 15 個(gè)孔)制成。
溶解凝膠(10ml)濃縮凝膠(3ml)

6%8%10%12%15%
H 2 05.34.64.03.32.32.1
30% 丙烯酰胺混合物*2.02.73.34.05.00.5
1.5M Tris(pH 8.8)2.52.52.52.52.51.0M Tris (pH 6.8) 0.38
10% SDS0.10.10.10.10.10.03
10% APS0.10.10.1.10.10.03
TEMED0.0080.0060.0040.0040.0040.003
 五、上樣和電泳
l 將 2X SDS 蛋白質(zhì)上樣緩沖液與蛋白質(zhì)樣品以 1:1 的比例混合。樣品預(yù)熱到 50-60°C。進(jìn)行預(yù)染。

六、蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移
將蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到 PVDF 或 NC 膜上進(jìn)行抗體檢測(cè)。
  • l 在 1X 轉(zhuǎn)印緩沖液中預(yù)潤(rùn)濕凝膠、Whatman 紙和海綿等材料。

  • l PVDF 膜應(yīng)在甲醇中孵育 10 秒。至 1 分鐘,然后移至 1X 轉(zhuǎn)移緩沖液。

  • l 將以下材料堆疊:外殼(黑色面)、海綿、Whatman 紙、凝膠、膜、Whatman 紙、海綿、外殼(透明面)。

  • l 將黑色面朝黑色放入轉(zhuǎn)印設(shè)備中。

  • l 在低溫環(huán)境中,使用轉(zhuǎn)印緩沖液進(jìn)行轉(zhuǎn)印操作。轉(zhuǎn)印電流和時(shí)間可以根據(jù)實(shí)驗(yàn)過(guò)程和使用說(shuō)明進(jìn)行優(yōu)化。


七、抗體孵育
  • l 一抗在 1X TBST+3% BSA 中以推薦的稀釋度稀釋或根據(jù)結(jié)果優(yōu)化稀釋度。

  • l 在 4°C 下孵育過(guò)夜或更長(zhǎng)時(shí)間,或在室溫下孵育 4 小時(shí)。

  • l 回收一抗并儲(chǔ)存在 4°C。然后在 RT 的振動(dòng)篩上洗滌膜 3X 5-10 分鐘。

  • l 在 1X TBST 中稀釋二抗并將膜在室溫下孵育 1 小時(shí)或在振蕩器上在 4°C 下孵育 2-4 小時(shí)。

  • l 在 RT 的搖床上用 TBST 洗滌 3X 10 分鐘。


ECL+ 系統(tǒng)和 X 射線膠片用于 HRP 標(biāo)記的二抗。

     蘇州阿爾法生物所提供的天能系列SDS-PAGE 、蛋白電泳預(yù)制膠、梯度預(yù)制膠、電泳儀、電泳槽、核酸電泳預(yù)制膠、核酸電泳儀、電泳儀電源、電泳槽等實(shí)驗(yàn)室設(shè)備。